原因
rbenv rehash すればいいらしいが、
rbenv で Ruby を上書きインストールすると
$ rbenv rehash rbenv: cannot rehash: /Users/username/.rbenv/shims/.rbenv-shim exists
となって rbenv rehash できない。 *1
対処
リネーム(or 削除)
$ mv /Users/username/.rbenv/shims/.rbenv-shim /Users/username/.rbenv/shims/.rbenv-shim2
rehash してcapify
$ rbenv rehash $ capify . [add] writing './Capfile' [add] writing './config/deploy.rb' [done] capified!
ファイル作成された
*1:追記:sudo つければ出来るかも